Lembaga CMM berada di bawah naungan Yayasan Ummatan Washata, yang dibentuk para ulama dan tokoh agama dari NU, Muhammadiyah, dan perwakilan ulama/tokoh agama dari ASEAN dalam konferensi internasional Islam dan Radikalisme pada 13-15 Oktober 2003. Adapun para pengurus yayasan sebagai berikut:
Dewan Penyantun:
Prof Dr A Syafii Maarif
KH Hasyim Muzadi
KH Ir Shalahuddin Wahid
Prof Dr Cecep Syarifuddin
Dewan Pendiri:
KH Dr Tarmizi Taher
KH Nuril Huda
Board of Director CMM
KH Dr dr Tarmizi Taher(Ketua/Indonesia)
KH Nuril Huda(Wakil Ketua/Indonesia)
Prof Dr Azyumardi Azra (Anggota/Indonesia)
KH At-Tabik Ali (Anggota/Indonesia)
Dr Zaenah Anwar (Anggota/Malaysia)
Muhammad Zakaria (Anggota/Singapura)
Abdul Qayum Yusuf, M.D (Anggota/Kamboja)
Prof Thaha Basman (Anggota/Philipina)
H. Abdul Ghani (Anggota/Malaysia)
Muhammad An-Nakhai (Anggota/Malaysia)
Prof Dr Alwi Shihab (Anggota/Indonesia)
Dr Candra Muzaffar (Anggota/Malaysia)
Board of Executive
Executive Director :
M Hilaly Basya, S.Ag
Chief of Programmer :
David Krisna Alka
Staff of Programmer :
Rahimi, S.Pd
Drs Syamsuddin
Andriansyah
Nunik Nurjanah
Office Mng.
Ir. Muchsin
Secretary :
Eva Dhela
Associate Reseacher :
Zuly Qodir MA (Yogyakarta)
Ahmad Fuad Fanani
Hery Sucipto